Eesti Judoliit on mittetulundusühinguna tegutsev ühendus, mille eesmärgid ja põhitegevus on suunatud judo harrastamisele ja selleks tingimuste loomisele ning mis ühendab judoga tegelevaid ja judot toetavaid spordiklubisid, -seltse ja -ühendusi Eestis.
EJL-i kõrgeim organ on üldkoosolek, kuhu kuuluvad liikmesklubid. Üldkoosolekute vahelisel ajal juhib tööd juhatus, kuhu kuulub hetkel 6 liiget, eesotsas president Kaido Kaljulaidiga. EJL igapäevase töö eest vastutavad peasekretär Elis Põhjala ja Spordidirektori Juhan Mettis. Lisaks on Judoliidul veel nõuandvad organid, kes tegelevad oma spetsiifiliste valdkondadega. Nendeks on Treenerite Nõukogu (esimees Glen Viks), Kohtunike Kolleegium (esimees Edward Murel), Kutsekvalifikatsiooni Komisjon (esimees Ando Pehme) ning DAN-kolleegium (esimeheks Egert Ehari). EJL nõuandvate organite hulgas on ka Aukohus, kuhu kuuluvad kõik EJL endised presidendid ning praegune president.